台湾金线莲转录组特性研究

编号 zgly0001496123

文献类型 期刊论文

文献题名 台湾金线莲转录组特性研究

作者 姜福星  魏丕伟  寇亚平  贾茵  陈其兵 

作者单位 四川农业大学园林研究所  四川理工学院生物工程学院  中国农业大学园艺学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2015年12期

年份 2015 

分类号 S567.239 

关键词 台湾金线莲  转录组分析  药用活性成份  微卫星标记 

文摘内容 台湾金线莲(Anoectochilus formosanus)是我国传统的珍贵药材,素有金草、神药等美称,具有很高的药用价值、观赏价值和经济价值。台湾金线莲的全草入药,且挥发油中也含有多种药用成份。本研究采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术,对其全草进行转录组分析,共获得原始数据5.3 Gb,有效数据4.4 Gb,Unigene有173 513条,Unigene平均长度为680 bp;通过与其他核酸、蛋白质数据库的Blast比对,58 451条得到Nr功能注释,21 386条得到COG功能分析,45 812条GO功能解释。KEGG代谢途径研究发现,130条Unigene与黄酮类物质有关,114条Unigene与生物碱有关,441条Unigene与萜类物质有关。搜索发现21 195个微卫星位点,其中单核苷酸最多有13 126个,占61.93%,其次分别是三核苷酸和二核苷酸,分别占17.4%和15.61%。