羊传染性脓疱病毒NZ2毒株CBP蛋白结构分析与表位预测

编号 zgly0001690762

文献类型 期刊论文

文献题名 羊传染性脓疱病毒NZ2毒株CBP蛋白结构分析与表位预测

作者 成伟伟  陈伯祥  常攀峰  杨明  赵子惠 

作者单位 甘肃省畜牧兽医研究所 

母体文献 中国动物检疫 

年卷期 2019年12期

年份 2019 

分类号 S852.654 

关键词 羊传染性脓疱病毒  CBP蛋白  生物信息学  结构分析  表位预测 

文摘内容 本研究应用生物信息学方法,以ORFV NZ2毒株的CBP蛋白氨基酸序列为研究对象,对CBP蛋白的理化特性、亲水性、跨膜区、信号肽、二级结构、三级结构、B细胞表位和T细胞表位进行了预测分析。结果显示,CBP蛋白的相对分子质量为31.179 89 kDa,理论等电点为4.68,半衰期为30 h,稳定系数为43.06,脂肪族指数为81.78,总平均亲水性为-0.383。CBP蛋白为亲水性蛋白,无跨膜区,不属于跨膜蛋白,存在信号肽;二级结构中α螺旋、β折叠、β转角、无规卷曲分别占38.11%、33.91%、5.94%和10.48%,三级结构形似倒立的哑铃,上下对称。筛选出了6个优势B细胞表位、3个CTL细胞表位,无Th细胞表位。CBP蛋白为亲水性膜外蛋白,细胞表位较少,在细胞膜外为ORFV逃避宿主免疫反应发挥作用。本研究为CBP蛋白的功能研究与ORFV的致病机制研究提供了理论依据。