巴西橡胶树核糖体蛋白S5基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0000636309

文献类型 期刊论文

文献题名 巴西橡胶树核糖体蛋白S5基因的克隆及生物信息学分析

学科分类 220.5570;林产化学加工学

作者 李德军  邓治  陈春柳  陈守才 

作者单位 中国热带农业科学院橡胶研究所／农业部橡胶生物学重点开放实验室 

母体文献 湖北农业科学 

年卷期 2009,48(12)

页码 2931-2935

年份 2009 

分类号 Q527.2  S794.1 

关键词 巴西橡胶树  核糖体蛋白S5  基因克隆  序列分析 

文摘内容 核糖体蛋白S5是核糖体蛋白家族的重要成员,在核糖体中发挥重要作用。利用本实验室获得的部分序列设计引物,采用3-RACE技术从巴西橡胶树胶乳中获得一个核糖体蛋白S5基因的完整阅读框,该基因编码209个氨基酸的多肽,含有一个典型的真核生物核糖体蛋白S5结构域。在HbRPS5氨基酸序列中没有预测到跨膜区和信号肽,二级结构分析表明HbRPS5属于混合型蛋白。对14个RPS5系统进化分析表明,巴西橡胶树的RPS5基因在进化上具有保守性,与植物类拟南芥的RPS5基因亲缘关系最近,而与人和酵母等亲缘关系相对较远。该基因的克隆和生物信息学分析为深入研究其功能奠定了基础。