巴西橡胶树LIM结构域基因克隆与生物信息学分析

编号 zgly0000647677

文献类型 期刊论文

文献题名 巴西橡胶树LIM结构域基因克隆与生物信息学分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 吴瑞  朱家红  张全琪  张治礼 

作者单位 海南大学农学院  中国热带农业科学院热带作物生物技术研究所  海南省农业科学院 

母体文献 热带生物学报 

年卷期 2010,1(1)

页码 62-66

年份 2010 

分类号 S794.1  Q785 

关键词 巴西橡胶树  基因克隆  LIM基因  生物信息学 

文摘内容 根据乙烯利刺激巴西橡胶树（Hevea brasiliensis）胶乳差异表达cDNA文库的EST序列信息，利用RACE技术从胶乳中成功克隆了1个含有LIM结构域的未知功能新基因HbLIM的全长cDNA。生物信息学分析表明，该基因全长cDNA由1016bp的碱基组成，拥有1个570bp的开放阅读框编码189个氨基酸残基；推测氨基酸序列富含Lys，Ser，Ala和Leu，含有2个LIM结构域和2个N-豆蔻酰化位置。序列相似性分析表明，HbLIM编码的氨基酸序列与蓖麻、杨毛、葡萄相应的LIM基因的相似性高达98％，95％和92％。这些研究结果为深入探讨LIM结构域蛋白在巴西橡胶树乳管发育及乳管代谢中的功能奠定了基础。