应用扩增性rDNA限制性酶切片段多态性分析技术研究竹鼠盲肠细菌菌群的多样性

编号 zgly0001458831

文献类型 期刊论文

文献题名 应用扩增性rDNA限制性酶切片段多态性分析技术研究竹鼠盲肠细菌菌群的多样性

作者 周建波  姜亚  宁俊平  曹晓燕  黄怡  王士长 

作者单位 广西大学动物科学技术学院 

母体文献 动物营养学报 

年卷期 2013年10期

年份 2013 

分类号 S865  S852.6 

关键词 竹鼠  16S rDNA  ARDRA  克隆 

文摘内容 本试验应用扩增性rDNA限制性酶切片段多态性分析(ARDRA)技术研究竹鼠盲肠细菌菌群的多样性。利用免培养的分子生物学技术,从竹鼠盲肠内容物中提取细菌的总DNA,用细菌通用引物F27/R1492扩增出细菌16S rDNA的基因,构建16S rDNA基因文库。采用HaeⅢ和HhaⅠ2种限制性内切酶对阳性克隆子的扩增产物进行酶切,挑选不同的操作分类单元(OTU)测序,通过Blast在线比对,分析竹鼠盲肠细菌菌群的多样性。结果表明:竹鼠盲肠中的细菌菌群大部分是未培养或未知的菌株,在分类学上具有潜在意义的被选菌株,而且存在可能和脂肪代谢有关的微生物群体。同时也有乳酸菌属、芽孢杆菌属、梭形杆菌属和多黏类芽孢杆菌属的分布。从结果中看出,芽孢杆菌属、梭形杆菌属和2个未知菌株的克隆数都大于20个,是优势菌株。