禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征

编号 zgly0001412407

文献类型 期刊论文

文献题名 禽流感病毒H3N8亚型野鸭源分离株基因特征

作者 王建琪  华育平  曾祥伟  张兰兰  程成  张玉稳 

作者单位 东北林业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2011年03期

年份 2011 

分类号 S852.65 

关键词 禽流感病毒  H3N8亚型  野鸭源分离株  序列分析 

文摘内容 根据已知禽流感病毒(AIV)的8个基因序列设计合成12对特异引物,通过反转录—聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,分别成功扩增出分离于野鸭(Mallard)的1株H3N8亚型禽流感病毒的全基因片段,将其分别克隆到pMD18-T载体后进行序列测定。同时将8个基因片段与GenBank发表的相应序列进行比较,绘制各基因的进化树。结果表明:所克隆到的8个片段均包含相应病毒基因的完整开放阅读框架,长度分别为PB2/2280、PB1/2276、PA/2150、HA/1734、NP/1497、NA/1413、MP/759、NS/838bp核苷酸,分别编码759、758、716、577、498、4702、52/962、30/125个氨基酸。A/mallard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株HA有7个潜在糖基化位点;在HA裂解位点序列为PEKQTR↓GLF,无连续的多个碱性氨基酸插入,具有典型的低致病性禽流感病毒特征。根据A/mal-lard/Sanjiang/359/2007(H3N8)株与参考毒株的序列比较分析结果推测,该分离株可能是不同亚型禽流感病毒通过互相基因交换所形成的基因重组体。