A/Grganey/SanJiang/160/2006(H5N2)分离株HA基因克隆及序列分析

编号 zgly0001350155

文献类型 期刊论文

文献题名 A/Grganey/SanJiang/160/2006(H5N2)分离株HA基因克隆及序列分析

作者 刘熠楠  李晓冰  柴洪亮  张兰兰  张进  华育平 

作者单位 东北林业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2009年07期

年份 2009 

分类号 S852.65 

关键词 H5N2亚型  禽流感病毒  HA基因  序列分析 

文摘内容 应用RT-PCR方法,对从一只野生白眉鸭(Anasquer quedula)中分离出的禽流感病毒分离株A/Gr-ganey/SanJiang/160/2006(H5N2)的HA基因进行了序列的克隆和测定。测序结果显示,克隆的HA基因全长为1731bp,共编码565个氨基酸。核苷酸和氨基酸的最大同源性比较结果表明,该毒株的HA基因与其它31株H5N2亚型禽流感病毒HA基因的同源性为71.0%～98.2%,氨基酸序列同源性为84.0%～98.2%;遗传进化关系表明,该毒株属于欧亚群系。通过血凝素裂解位点的氨基酸序列分析可知,该毒株的HA切割位点上未见到典型的高致病力毒株H5、H7所具有的一系列碱性氨基酸,符合低致病力禽流感毒株的分子特征。