紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、 进化及表达分析

编号 zgly0001617180

文献类型 期刊论文

文献题名 紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、 进化及表达分析

作者 齐晓  张正社  闵学阳  孙启忠  刘文献 

作者单位 中国农业科学院草原研究所  全国畜牧总站全国草品种审定委员会办公室  草地农业生态系统国家重点实验室兰州大学草地农业科技学院 

母体文献 草业科学 

年卷期 2017年08期

年份 2017 

分类号 S541.9 

关键词 bZIP转录因子  紫花苜蓿  系统进化分析  密码子偏好性 

文摘内容 碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子是真核生物转录因子中分布最广泛、最保守的一类蛋白。目前在许多植物中已发现大量的bZIP转录因子,这些bZIP转录因子成员广泛参与种子贮藏基因的表达、植物的生长发育、光信号传导、病害防御、生物和非生物胁迫应答以及ABA的敏感性等各种信号的反应。本研究首次从紫花苜蓿(Medicago sativa)全转录组水平鉴定出bZIP转录因子家族共包含138个基因,根据bZIP蛋白序列进行系统进化分析可以将其分为10类;对MsbZIP基因的系统进化分析表明该基因家族在分类上有很高的保守性。该转录因子家族的基因密码子偏好性分析表明,MsbZIP基因密码子偏好使用A/T碱基。此外,MsbZIP基因GO功能注释分析结果显示,138个MsbZIP基因最终分为23个GO分类,总体包括分子功能和生物学过程两类。相关性分析结果表明,共有372对基因表达相关性极显著(P<0.01)。本研究可为紫花苜蓿bZIP转录因子功能特性、进化历程和生物功能的深入研究奠定基础。