基于高通量测序的云南松转录组分析

编号 zgly0001007925

文献类型 期刊论文

文献题名 基于高通量测序的云南松转录组分析

作者 蔡年辉  邓丽丽  许玉兰  徐杨  周丽  王大玮  田斌  何承忠  段安安 

作者单位 西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室  西南林业大学国家林业局西南地区生物多样性保育重点实验室  西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室 

母体文献 植物研究 

年卷期 2016(1)

页码 75-83

年份 2016 

关键词 云南松  转录组  Illumina高通量测序 

文摘内容 采用新一代高通量测序技术平台Illumina Hiseq 2 000对云南松转录组测序,得到的数据进行de novo组装,获得80 000条Unigenes,N50为1 881 nt、平均890 nt。与公共数据库进行比对,注释到NR、NT、Swiss-Prot数据库的Unigenes分别为43 434、46 415、29 418条。