基于Illumina高通量测序的泡桐转录组研究

编号 zgly0000817496

文献类型 期刊论文

文献题名 基于Illumina高通量测序的泡桐转录组研究

作者 邓敏捷  董焱鹏  赵振利  张晓申  范国强 

作者单位 河南农业大学泡桐研究所 

母体文献 林业科学 

年卷期 2013(6)

页码 30-36

年份 2013 

分类号 S718.46 

关键词 泡桐  转录组  Illumina高通量测序  从头组装 

文摘内容 利用新一代高通量测序技术平台Illumina Solexa对泡桐进行转录组测序和数据denovo组装,并对得到的unigene进行功能注释、分类及代谢通路分析。结果表明,N50值为2278bp、平均长度为1410bp的泡桐unigene共有188019条,将其与NCBI的Nr和Swiss-Prot数据库比对后发现,分别有120808条和85880条unigene与其他物种的基因具有同源性。利用COG数据库可将有关的41914条泡桐unigene分成25类,KEGG数据库分析发现共有43553个unigene参与215种代谢通路。找到与木质素合成相关的泡桐unigene。