SSR数据格式转换软件DataFormater

编号 zgly0001528800

文献类型 期刊论文

文献题名 SSR数据格式转换软件DataFormater

作者 樊文强  盖红梅  孙鑫  杨爱国  张忠锋  任民 

作者单位 中国农业科学院烟草研究所烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室  中国农业科学院研究生院  青岛市农业科学研究院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2016年01期

年份 2016 

分类号 TP319  Q75 

关键词 分子群体遗传学  分子标记  SSR  数据格式  软件  Python计算机语言 

文摘内容 随着分子群体遗传学的快速发展和SSR标记的广泛应用,一些分子群体遗传学分析软件相继问世。但是不同软件的SSR数据输入文件格式并不一致,人工转换费时费力,且易出错。因此,本研究利用Python高级计算机语言开发了SSR分子标记数据格式转换软件Data Formater。该软件具有友好的图形用户界面,能高效准确的把SSR原始数据快速转换为Popgene、Ntsys、Power Marker、Structure、Tassel、SPAGe Di等常用分子群体遗传学分析软件的输入文件,同时还具过滤稀有等位、过滤无多态位点、用户数据校验等功能。与人工转换相比,Data Formater可大大提高转换的效率和准确性。因此,Data Formater将是分子群体遗传学研究中不可或缺的工具软件。现在用户可以通过Data Formater软件的主页进行下载,网址为:www.ycsjk.com.cn/dataformater/home/,或通过电子邮件renmin@caas.cn索取该软件。