玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析

编号 zgly0001678240

文献类型 期刊论文

文献题名 玉米CCT基因家族的鉴定与生物信息学分析

作者 郭栋  杜媚  周宝元  高卓晗  曹哲统  赵明 

作者单位 中国农业科学院作物科学研究所  东北农业大学农学院  河北北方学院农林科技学院  北京化工大学生命科学与技术学院 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2019年04期

年份 2019 

分类号 S513 

关键词 玉米  CCT  生物信息学分析  蛋白结构 

文摘内容 CCT(CO、COL和TOC1)家族基因广泛参与植物花期的调控过程,对植物的生长与发育起着至关重要的作用。本研究以玉米为材料,共鉴定出57个CCT基因,命名为ZmCCT1～ZmCCT57,利用生物信息学方法开展玉米ZmCCTs基因的结构、氨基酸特点、染色体定位及基因进化分析,还与其他物种的CCT基因家族进行对比分析。结果表明,CCT基因家族在染色体上呈现不均匀分布,其中5号染色体分布最多(11个),3、7、10号等染色体分布最少(均只有3个)。CCT基因家族具有相对保守的结构,即每个基因都包含保守的CCT DNA结构,其他少数基因含有其他DNA结构,CCT蛋白的3 D结构含有1个α螺旋与3个β折叠。根据多物种CCT蛋白的进化树分析依据相似性将其分为8个分支,分析结果显示单子叶植物玉米与谷子、二穗短柄草CCT基因保守性更强,亲缘关系更近。本研究为进一步揭示玉米CCT基因家族的功能机制提供了相应的参考。