梅花鹿鹿茸组织PDGFA基因cDNA克隆及序列分析

编号 zgly0001557947

文献类型 期刊论文

文献题名 梅花鹿鹿茸组织PDGFA基因cDNA克隆及序列分析

作者 梁运涛  卢斌山  张强  高悦禹  夏彦玲 

作者单位 东北林业大学 

母体文献 东北林业大学学报 

年卷期 2017年11期

年份 2017 

分类号 S825 

关键词 梅花鹿  PDGFA基因  克隆  序列分析  进化分析 

文摘内容 为了探讨PDGFA基因的结构和功能,采用RT-PCR方法获得梅花鹿PDGFA基因,并运用生物信息学软件对其序列进行了分析。结果表明:梅花鹿PDGFA基因开放阅读框大小为591 bp,共编码196个氨基酸,蛋白的分子质量约为22 ku,理论等电点(pI)为8.53,是亲水性蛋白,具有信号肽。二级结构分析显示,含有47.45%无规则卷曲、39.29%α-螺旋、13.27%扩展链。进化分析显示,PDGFA蛋白与白尾鹿(Odocoileus virginianus texanus)、家牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)、野猪(Sus scrofa)、白犀牛(Ceratotherium simum)、小鼠(Mus musculus)、密西西比鳄(Alligator mississippiensis)、原鸡(Gallus gallus)、绒啄木鸟(Picoides pubescens)的蛋白质序列相似度分别为98%、97%、96%、94%、93%、89%、81%、79%、78%。