十字花科植物SAMDC基因同源序列的克隆与进化分析

编号 zgly0000504204

文献类型 期刊论文

文献题名 十字花科植物SAMDC基因同源序列的克隆与进化分析

作者 丁淑丽  卢钢  李建勇  任彦  曹家树 

作者单位 浙江大学园艺系农业部园艺作物生长发育与生物技术重点实验室 

母体文献 遗传 

年卷期 2007,29(1)

页码 109-117

年份 2007 

分类号 Q949.748.3 

关键词 十字花科植物  SAMDC基因  克隆  进化分析 

文摘内容 腺苷甲硫氨酸脱羧酶(SAMDC)是参与植物多胺合成的一个关键酶。根据GenBank中已报道的SAMDC基因编码序列保守区域设计特异引物, 运用PCR技术分另4从十字花科6属14个物种中新克隆分离了SAMDC基因的同源序列。比较分析结果表明: 这些同源序列的相似性达87%以上, 所推导的氨基酸序列相似性达90%以上, 且两者种间差异分别为0.2%～10.1%和0.3%～6.6%, 属间差异除“圆白”萝卜外分别是4.9%。13.6%和3.1%～10.3%; SAMDC基因的核苷酸及其可能编码的氨基酸序列差异属间较种间大, 可用于属间的分类等级研究; 且氨基酸序列间的差异比核苷酸序列间的差异小的多, 因而根据核苷酸序列构建了NJ与ME分子系统树。进化树直观地表明在亲缘进化关系上芸薹属与萝卜属较近, 其他依次为山芥属、萍菜属、拟南芥属, 与荠菜属最远。研究结果有助于从分子水平阐明十字花科植物间的亲缘进化关系, 可为其种质资源利用提供理论依据。