芋花叶病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析

编号 zgly0001420102

文献类型 期刊论文

文献题名 芋花叶病毒的RT-PCR检测及外壳蛋白基因序列分析

作者 施世明  王国平  徐文兴  王利平  洪霓 

作者单位 华中农业大学植物科技学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室  华中农业大学农业微生物学国家重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2012年03期

年份 2012 

分类号 S436.32 

关键词 芋  芋花叶病毒  RT-PCR  外壳蛋白基因  序列分析 

文摘内容 采用RT-PCR技术对采自中国湖北、浙江和山东的91份芋[Colocasia esculenta(L.)Schott]样品的芋花叶病毒(Dasheen mosaicvirus,DsMV)进行了检测,检出率为26.4%。对其中14个DsMV分离物的317bp扩增产物(为外壳蛋白基因的一部分)序列分析的结果显示,各分离物内的核苷酸变异相对较低,而分离物间存在较大的分子变异,相似性为68.3%~97.8%。对来自湖北和浙江的2个DsMV分离物DsMV-SCS和DsMV-JH的外壳蛋白基因(coatproteingene,cp)进行了测序,全长分别为951bp和987bp,二者cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为79.0%和82.3%,与已报道DsMV的cp核苷酸和氨基酸序列相似性分别为73.0%~92.1%和74.8%~98.2%,在构建的系统发育树上聚在两个不同的簇,各DsMV分离物的系统进化关系与其寄主和地理来源无显著相关性。