磁珠富集法开发蕨麻SSR标记引物

编号 zgly0001623836

文献类型 期刊论文

文献题名 磁珠富集法开发蕨麻SSR标记引物

作者 富贵  李军乔  包锦渊  白世俊  韦梅琴 

作者单位 青海民族大学青藏高原蕨麻研究中心  青海省高原作物种质资源创新与利用国家重点实验室培育基地  青海省生物技术与分析测试重点实验室  青海大学农牧学院 

母体文献 草业学报 

年卷期 2018年02期

年份 2018 

分类号 S668.9 

关键词 蕨麻  微卫星  磁珠富集  分子标记 

文摘内容 微卫星序列(SSR)因具有分布广、共显性遗传、稳定、多态性丰富等优点而被广泛应用于动植物遗传研究中。利用EcoRⅠ,MseⅠ2种内切酶酶切蕨麻基因组,酶切片段与用生物素标记的探针(AG)15、(GT)15杂交,然后通过链霉亲和素磁珠富集、含有SSR片段的基因组片段被吸附,再经洗脱、PCR扩增、克隆和测序,完成微卫星序列的收集。共获得有效克隆236个,随机挑选其中80个进行测序,结果显示68条序列(85%)为唯一序列,挑选出其中40条含有SSR位点的序列,用引物设计软件Primer 5成功设计出40对引物,经初步筛选,最终获得多态性丰富,可稳定扩增的SSR引物20对,扩增成功率达50%。对20对引物扩增结果做了初步分析,扩增出多态性位点共338个,平均每对引物扩增出17个,平均有效等位基因数(Ne)、多态性信息含量(PIC)、Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)平均值分别为1.2440、0.8996、0.1768和0.3078。20对SSR引物为蕨麻遗传变异研究提供了新的分子标记工具。