金针菇单、双核菌丝差异表达基因分析

编号 zgly0001497146

文献类型 期刊论文

文献题名 金针菇单、双核菌丝差异表达基因分析

作者 王威  丑天胜  刘芳  严俊杰  吴塔菊  李少杰  谢宝贵 

作者单位 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心  中国科学院微生物研究所 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2015年04期

年份 2015 

分类号 S646.15 

关键词 转录组  差异表达基因  GO功能  Pathway分析 

文摘内容 对金针菇Flammulina velutipes单核菌丝W23的菌丝体以及与L11质配后的双核菌丝H1123菌丝体进行了转录组测序,以本实验室已获得的W23基因组为参考基因组研究两样本间差异基因,并对这些差异基因进行了GO功能和Pathway显著性富集分析。差异基因分析显示,两个样本中共有显著性差异表达的基因3 504个,其中在双核菌丝中上调、下调的基因数分别为2 151和1 353个。研究发现差异表达基因含有很多的转录因子基因、蛋白激酶以及WD40 repeat-like蛋白。Gene Ontology(GO)功能分析结果表明,extracellular region和membrane-enclosed lumen条目下的差异基因全部为上调表达,而envelope下的差异基因全部为下调表达,以利于双核菌丝分裂时锁状联合的形成而便于核的迁移。Pathway功能富集分析结果表明,脂肪酸、氨基酸以及大部分糖类合成相关基因具有比较活跃的上调表达。说明双核菌丝主要进行营养物质的富集,为下一步在合适条件下分化成原基,进入生殖生长阶段储备物质基础。