金针菇菌丝与原基差异表达基因分析

编号 zgly0001466909

文献类型 期刊论文

文献题名 金针菇菌丝与原基差异表达基因分析

作者 刘芳  王威  谢宝贵 

作者单位 福建农林大学菌物研究中心 

母体文献 食用菌学报 

年卷期 2014年01期

年份 2014 

分类号 S646.15 

关键词 原基  差异基因表达  GO功能  Pathway分析 

文摘内容 以金针菇(Flammulina velutipes)1123菌株的单孢W23基因组为参考完成其菌丝和原基转录组测序与数据分析,研究两样本间差异基因,并对差异基因进行GO功能和KEGG Pathway显著性富集分析。结果表明:两个样本中共有显著性差异表达的基因3310个,其中在原基中上调、下调的基因数分别为1686、1624个,只在原基中表达的基因有26个。GO功能分析结果表明,在原基中膜封闭腔、内膜系统、细胞器腔、核糖核蛋白复合体、翻译调节器、发育过程、免疫系统过程、多细胞生物过程这8个GO基本单元中的差异基因全部呈现上调表达。Pathway功能富集分析结果表明,核糖体与DNA复制中的差异基因全部呈现上调表达,糖酵解途径中从D-葡萄糖转化成丙酮酸过程相关的11个差异基因全部呈下调表达,磷酸戊糖途径中相关的13个差异基因中有11个基因呈下调表达。