黑腹果蝇miRNA前体的预测

编号 zgly0000717835

文献类型 期刊论文

文献题名 黑腹果蝇miRNA前体的预测

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 马闯  胡星驰  童潘  黄慧艳 

作者单位 华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室  华中科技大学生命科学与技术学院 

母体文献 中南林业科技大学学报: 自然科学版 

年卷期 2010,30(6)

页码 127-131

年份 2010 

分类号 Q811.4 Q75 

关键词 生命科学与技术  黑腹果蝇  miRNA  靶标基因  结合位点 

文摘内容 MicroRNA(miRNA)是一类长度约23 nt的内源性单链小分子RNA,它通过与靶标结合位点区域的碱基互补结合来调控靶标基因的表达。通过寻找潜在的miRNA结合位点预测miRNA前体,首先在黑腹果蝇mRNA的3’UTR区域中搜寻潜在的miRNA结合位点,然后根据碱基配对原则以及miRNA前体的结构序列特征来预测可能存在的miRNA前体。在黑腹果蝇全基因组范围内对其miRNA的预测结果证实了该方法的有效性。该方法还可应用到其他物种的miRNA发现研究中。