甘蔗ScHAK9基因克隆及表达分析

编号 zgly0001639711

文献类型 期刊论文

文献题名 甘蔗ScHAK9基因克隆及表达分析

作者 罗海斌  黄诚梅  蒋胜理  曹辉庆  邓智年  吴凯朝  徐林  陆珍  魏源文 

作者单位 广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室  广西农业科学院甘蔗研究所/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室 

母体文献 植物遗传资源学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S566.1 

关键词 甘蔗  钾转运蛋白(HAK)  基因克隆  生物信息学分析  基因表达 

文摘内容 KUP/HAK/KT家族基因在介导细胞内钾的积累及维持植物的生长发育中起重要作用,本研究以新台糖22号(ROC22)甘蔗为研究材料,采用同源克隆技术获得钾转运ScHAK9基因的完整编码序列(CDs),并利用生物信息学软件对蛋白质结构和功能进行预测分析,同时利用qPCR技术分析基因的组织特异性表达以及在不同干旱条件下的表达情况。结果表明,ScHAK9基因的cDNA完整编码区长度为2352 bp,编码783个氨基酸,属于碱性疏水蛋白,结构中包含了12个跨膜结构域,蛋白主要定位在细胞质膜上;蛋白质二级结构主要由α螺旋结构、无规则卷曲结构和扩展长链组成;系统发育树分析显示ScHAK9与玉米Zm HAK9基因同源性较高。qPCR分析结果表明,ScHAK9基因在不同组织间的相对表达量具有明显差异,叶片中表达最高,其次是茎,根系中表达最低,具有组织特异性;干旱胁迫可以诱导ScHAK9基因表达,其表达量随着胁迫程度加重表现出升高趋势,且在复水后才有所下降。初步推测该基因可能在甘蔗发育和抵御干旱胁迫中起着重要作用,本研究为进一步阐明ScHAK9的功能及作用机制奠定了分子基础。