香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析

编号 zgly0001668868

文献类型 期刊论文

文献题名 香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析

作者 黎维丽  余乃通  李俊成  王健华  李宾宾  刘志昕 

作者单位 海南大学热带农林学院  中国热带农业科学院热带生物技术研究所·海南省微生物学重点实验室·农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室  广东省农业科学院果树研究所·广东省热带亚热带果树研究重点实验室 

母体文献 果树学报 

年卷期 2019年05期

年份 2019 

分类号 S436.68 

关键词 香蕉条斑病毒  ORFⅠ  同源蛋白  生物信息学分析 

文摘内容 【目的】探明杆状DNA病毒属病毒的ORFⅠ基因功能。【方法】本研究从香蕉条斑病毒云南分离株(BSV-YN)中克隆了BSV ORFⅠ基因,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN的分类地位;对其编码蛋白及同源物的理化性质、氨基酸序列组成、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、同源结构域、蛋白二级和三级结构等进行预测和分析。【结果】BSV ORFⅠ基因片段大小为528 bp,编码175个氨基酸,通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析,确定了BSV-YN属于BSGFV种。生物信息学分析表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白都是不稳定的、亲水性蛋白,以丝氨酸和苏氨酸磷酸化为主。这些蛋白二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成,无信号肽或跨膜区域。亚细胞定位预测表明,BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白主要在细胞核分布,推测它们在病毒感染的宿主细胞核中发挥重要作用。【结论】推测BSV-YN ORFⅠ在病毒感染的宿主细胞核中参与病毒复制、转录等相关过程。本研究为进一步开展该蛋白的功能研究提供科学线索。