大岩桐花萼和幼叶转录组研究

编号 zgly0001493707

文献类型 期刊论文

文献题名 大岩桐花萼和幼叶转录组研究

作者 费元  韩雪  余红  庞基良 

作者单位 杭州师范大学生命与环境科学学院  杭州市农业科学研究院生物技术研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2015年12期

年份 2015 

分类号 S682.29 

关键词 大岩桐  花萼  幼叶  转录组  生物信息学分析 

文摘内容 利用新一代高通量测序技术平台Illumina Solexa GAⅡx对大岩桐花萼和幼叶进行转录组测序和数据从头组装及生物信息学分析,获得了长度大于100 bp的转录物22 821条;转录本总长度28.63Mb,N50长度1 548 bp,序列平均长度953 bp。转录物注释结果显示,15 053条有同源比对信息;7 768条无匹配序列信息,可能为大岩桐特有的基因序列。通过对花萼、幼叶中与激素代谢、信号转导相关的差异KEGG通路比较,推断在花萼中促进生长激素合成基因的表达比幼叶中强,激素信号转导组分基因的表达也比幼叶中强。