木薯(Manihot esculenta)AKT1基因的克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001693826

文献类型 期刊论文

文献题名 木薯(Manihot esculenta)AKT1基因的克隆及生物信息学分析

作者 陈秀珍  白雪杨  朱云峰  刘银弟  江行玉  周扬 

作者单位 海南大学热带作物学院海南省耐盐作物生物技术重点实验室  海南大学园艺学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 Q943.2  S533 

关键词 木薯(ManihotesculentaCrantz)  K+通道蛋白  AKT1  生物信息学分析 

文摘内容 植物细胞中的K~+通道蛋白AKT1 (Arabidopsis K~+ transpoter 1)主要负责吸收K~+。本研究基于木薯基因组数据库信息,利用PCR技术从木薯中克隆一个MeAKT1基因,该基因全长2 634 bp,编码877个氨基酸,生物信息学分析表明MeAKT1含有10个外显子和9个内含子,编码的氨基酸分子量为99.02 kD,等电点为8.43,属于稳定蛋白。MeAKT1包含有5个跨膜区域,N端含有1个Ion_trans结构域,C端有1个KHA结构域,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,进化树分析发现MeAKT1与蓖麻RcAKT1的亲缘关系最近。通过对MeAKT1蛋白的生物信息学分析有助于下一步深入研究MeAKT1在木薯耐贫瘠过程中的功能。