黄瓜SAUR基因家族的鉴定与表达分析

编号 zgly0001674371

文献类型 期刊论文

文献题名 黄瓜SAUR基因家族的鉴定与表达分析

作者 王红飞  尚庆茂 

作者单位 中国农业科学院蔬菜花卉研究所农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S642.2 

关键词 黄瓜  SAUR  基因表达  进化分析 

文摘内容 SAUR(Small auxin-up RNA)是生长素早期响应基因。基于黄瓜(Cucumis sativus L.)基因组数据,对CsaSAUR进行鉴定以及染色体定位、基因结构、启动子顺式作用元件分析,并通过qRT-PCR技术检测基因组织表达模式和对弱光、高温及高水势的响应。结果表明,在黄瓜基因组中共鉴定到73个SAUR,这些基因非随机地分布在7条染色体上,60%成簇分布;系统进化分析显示,CsaSAURs可分为8个进化群,各群基因数量不等;进一步分析家族成员的启动子序列,鉴定到IAA、ABA、GA、JA、SA及干旱、低温和机械损伤等信号响应的顺式作用元件;该家族成员具有不同的表达模式,弱光、高温和高水势可激活或抑制部分家族成员的表达,在下胚轴特异表达的18个Csa SAUR基因中,仅CsaSAUR15同时受弱光、高温、高水势3种信号诱导,表达上调。