辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析

编号 zgly0001514108

文献类型 期刊论文

文献题名 辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析

作者 郑忠凡  张亚利  胡灿  戴雄泽  刘峰  袁祖华 

作者单位 中南大学研究生院隆平分院  湖南中医药大学药学院  湖南省农业科学院蔬菜研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2016年04期

年份 2016 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  LBD基因家族  进化分析  基因表达 

文摘内容 利用生物信息学的方法,从辣椒基因组中鉴定出45个LBD基因,这些基因分布于辣椒9条染色体上。该家族成员内含子数整体上不超过3个,结构相对简单。进化关系显示辣椒LBD基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族具有一定的时空表达特异性。qRT-PCR结果表明,热激胁迫可以明显激活或抑制部分LBD基因的表达,其中ClassⅡ类基因较ClassⅠ类对高温具有更高的敏感性。