哈氏黄瓜NAC转录因子的鉴定及低温表达分析

编号 zgly0001674390

文献类型 期刊论文

文献题名 哈氏黄瓜NAC转录因子的鉴定及低温表达分析

作者 赵艳青  杜建厂  王盼乔  秦晓东  陈劲枫 

作者单位 南京农业大学园艺学院  江苏省农业科学院种质资源与生物技术研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2019年07期

年份 2019 

分类号 S642.2 

关键词 黄瓜  哈氏黄瓜  NAC转录因子  低温胁迫  基因表达 

文摘内容 以哈氏黄瓜(Cucumis sativus var. hardwickii)为试验材料,基于全基因组测序结果,利用生物信息学分析方法,鉴定获得77个NAC转录因子,其结构高度保守,序列长度在151～653个氨基酸之间,在7条染色体中呈非均匀分布;理论等电点在4.54～9.10之间;大部分转录因子定位在细胞核和细胞质膜上;系统发生分析显示所有NAC转录因子聚类为6个亚家族,其中亚家族Ⅲ序列结构较为多样性;进化分析发现NAC转录因子存在片段重复和串联重复等复制模式,没有发生近代的全基因组复制事件,并在进化过程中受到纯化选择作用;NAC转录因子基因在哈氏黄瓜幼苗根中表达量最高,其次为雌花和叶片;荧光定量分析发现,低温处理下,检测的15个NAC基因中有12个显著上调表达,3个下调表达,并存在一组表达量差异明显的HdNAC32–Hd ANC47片段复制基因对。由此可知NAC转录因子在受低温胁迫的哈氏黄瓜中发挥重要的转录调控作用。