不同花色印度野牡丹转录组功能注释和分析

编号 zgly0001566383

文献类型 期刊论文

文献题名 不同花色印度野牡丹转录组功能注释和分析

作者 林艺华  吴小斌  郑涛  林宗铿  陈振东 

作者单位 福建省热带作物科学研究所  广东省生物工程研究所(广州甘蔗糖业研究所) 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2017年06期

年份 2017 

分类号 Q943.2  S685.11 

关键词 印度野牡丹  花色  转录组  功能注释 

文摘内容 印度野牡丹(Melastoma malabathricum)属于野牡丹科野牡丹属,是双子叶有花植物,具有优良的观赏价值和药用价值,在未来的城乡绿化中具有较大的应用潜力和景观贡献力。本研究以粉色和白色的印度野牡丹为材料,采用RNA-seq转录组测序获得54 725条Unigene,并分别通过Nr、SwissProt、KOG和KEGG 4个数据库分别进行同源比对和功能注释,其中有11 319条Unigenes在4个数据库中都注释到了相应的功能基因。GO注释到123 355个Unigenes分为3个本体49个功能组,KEGG注释到7 880条Unigenes涉及129种代谢途径,其中部分Unigene涉及花色素合成途径、类黄酮合成途径、类胡萝卜素等合成途径。这些研究结果为后续深入开展印度野牡丹花青素等物质代谢合成途径及相关基因研究奠定基础。