猫杯状病毒的分离鉴定及其全基因组的序列分析

编号 zgly0001517085

文献类型 期刊论文

文献题名 猫杯状病毒的分离鉴定及其全基因组的序列分析

作者 何平  杨文娟  李法凯  赵卫锋  周华波  李瑞凯  梁明丽  韦红云  何剑桥  祝健  韦祖樟  黄伟坚  陈樱 

作者单位 广西大学动物科学技术学院  南宁市华波宠物医院 

母体文献 中国动物传染病学报 

年卷期 2016年01期

年份 2016 

分类号 S852.65 

关键词 猫杯状病毒  全基因组  遗传进化分析 

文摘内容 本研究采用MDCK细胞从养殖场患病猪的鼻拭子样品中分离获得1株猫的杯状病毒(Feline calicivirus,FCV),命名为GX01-2013。采用RT-PCR方法扩增了该毒株的全基因组,并进行了序列测定和分析。结果表明,该毒株基因组全长7704 bp,与哈尔滨分离株HRB-SS较为相近,其核苷酸同源性为82.3%。根据FCV衣壳蛋白构建的遗传进化树分析,发现该病毒与F9、F4、225和2024疫苗株均不在同一分支,氨基酸同源性为84.2%~87.7%,各毒株间无明显地域差异。此外,VP1蛋白的E区(426~521aa)发现有4个中和性抗原位点发生改变。