烟台市富士苹果上苹果锈果类病毒分子变异分析

编号 zgly0001644211

文献类型 期刊论文

文献题名 烟台市富士苹果上苹果锈果类病毒分子变异分析

作者 赵玲玲  刘娟  宋来庆  张学勇  张硕  姜中武 

作者单位 山东省烟台市农业科学研究院  烟台大学生命科学学院 

母体文献 植物保护学报 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S436.611 

关键词 富士苹果  苹果锈果类病毒  变异序列  序列分析 

文摘内容 为明确苹果锈果类病毒(Apple scar skin viroid,ASSVd)在烟台市富士苹果上的变异情况,通过特异性引物对携带苹果锈果类病毒的富士嫩叶进行ASSVd全长扩增,利用生物学软件DNAMAN对所得变异序列进行分析并构建系统进化树。结果表明,从130个样品中筛选到36个阳性样品,36个阳性样品中共克隆获得52条329~333 nt的ASSVd变异序列,其中30个阳性样品含2条或2条以上的ASSVd序列。对所得变异序列进行序列比对发现,同一样品不同克隆间核苷酸序列相似性为94.0%~100.0%,所有变异序列核苷酸序列相似性为94.0%~99.7%,与Gen Bank中来自不同国家或地区的10条ASSVd分离物核苷酸序列相似性为88.3%~99.7%。将序列相似性低于97.0%的12条变异序列进行系统进化分析,结果显示除了333 nt变异序列ZS2-6与伊朗苹果分离物在同一分支外,其余11条变异序列位于同一分支。52条变异序列多序列比对发现,变异位点主要集中在TL区、P区和C区。研究表明烟台市富士苹果上ASSVd存在一定的分子变异。