甘薯盐胁迫响应基因IbMYB3的表达特征及生物信息学分析

编号 zgly0001706331

文献类型 期刊论文

文献题名 甘薯盐胁迫响应基因IbMYB3的表达特征及生物信息学分析

作者 李格  孟小庆  李宗芸  朱明库 

作者单位 江苏师范大学生命科学学院/江苏省药用植物生物技术重点实验室 

母体文献 植物学报 

年卷期 2020年01期

年份 2020 

分类号 S531 

关键词 生物信息学分析  表达特征  IbMYB3  甘薯  转录激活 

文摘内容 MYB转录因子具有多种生物学功能,在植物响应生物和非生物胁迫中发挥重要作用。该文从盐胁迫后的甘薯(Ipomoeabatatas)水培苗转录组数据(RNA-seq)中筛选出2个受盐胁迫显著上调表达的MYB基因,分别命名为IbMYB3和IbMYB4。多种非生物胁迫和植物生长物质处理下的基因表达分析显示, IbMYB3受逆境诱导显著上调表达,暗示其可能参与甘薯非生物胁迫响应。生物信息学分析表明,IbMYB3开放阅读框长度为1059bp,编码353个氨基酸残基,蛋白分子量为39.41kDa,理论等电点(PI)为5.26,为酸性带负电的亲水性蛋白。亚细胞定位结果表明,IbMYB3蛋白定位于细胞核,具有较强的转录激活活性。上述结果表明, IbMYB3转录因子可能在甘薯非生物胁迫响应过程中发挥重要调控作用,研究结果为进一步探明IbMYB3基因的功能奠定了基础。