番茄TCP转录因子家族的鉴定和生物信息学分析

编号 zgly0001652543

文献类型 期刊论文

文献题名 番茄TCP转录因子家族的鉴定和生物信息学分析

作者 李菲  何小红  张宇斌  乙引 

作者单位 贵州师范大学生命科学学院植物生理与发育调控贵州省重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年21期

年份 2018 

分类号 S641.2 

关键词 西红柿  信号传导  系统进化  TCP 

文摘内容 TCP转录因子家族是植物特有的基因家族,处于植物多种信号传导途径的中心节点位置,在各种信号传导途径的交叉处起重要作用,调节植物关键的生理生化过程。利用番茄的基因组测序数据,我们对番茄全基因组的TCP基因进行筛选、鉴定和分析。番茄基因组中共有36个TCP基因。这些基因的蛋白质特征,如大小和等电点,差异较大。应该与TCP基因处在信号传导网络的节点,需要与各种各样的蛋白质特异性结合有关。番茄TCP基因结构较为简单,一般不含内含子。但是三号和六号染色体上的9个TCP基因,有5个基因带有一个内含子。系统进化分析表明这五个基因亲缘关系较近。番茄与拟南芥、水稻TCP家族的系统进化分析表明,番茄的全部TCP基因和水稻的基因亲缘关系更近。水稻TCP基因的功能信息,可以给我们提供番茄对应基因的功能信息。