番茄生长素响应因子基因家族的鉴定和生物信息学分析

编号 zgly0001648411

文献类型 期刊论文

文献题名 番茄生长素响应因子基因家族的鉴定和生物信息学分析

作者 李菲  何小红  李欲轲  乙引 

作者单位 贵州师范大学生命科学学院贵州省植物生理与发育调控重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年19期

年份 2018 

分类号 S641.2  Q943.2 

关键词 番茄  生长素响应因子  基因家族  系统进化  信号传导 

文摘内容 ARFs (auxin response factors)是植物生长素信号感知和信号传导途径非常关键的转录因子,在植物发育、生物、非生物胁迫和生长趋向性的响应等方面起到极端重要的作用。对番茄全基因组ARFs基因家族成员进行筛选、鉴定和生物信息学分析,具有极其重要的意义。番茄基因组中共有22个ARFs基因。9个番茄ARFs基因由600～700个氨基酸编码,是番茄ARFs基因大小比较集中的区间。72.7%(16/22)的番茄ARFs基因等电点小于7,在pH 5.39～6.84的区间内。绝大多数番茄ARFs基因结构较为复杂,有数十个内含子。不过有一个番茄ARFs进化分枝,内含子较少。番茄和拟南芥ARFs全部基因的系统进化分析表明,番茄缺少拟南芥1号染色体上7个ARFs基因组成的一个进化分枝。番茄ARFs基因表达表现出显著的组织特异性和随发育阶段的变化。