全球副溶血弧菌环境菌株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型

编号 zgly0000974458

文献类型 期刊论文

文献题名 全球副溶血弧菌环境菌株的基于碱基序列和肽链序列的多位点序列分型

作者 徐嘉良  杜小莉  卢昕 

作者单位 北京工商大学食品学院  食品添加剂与配料北京高校工程研究中心  中国疾病预防控制中心传染病预防控制所  传染病预防控制国家重点实验室 

母体文献 食品科学 

年卷期 2015(21)

页码 95-99

年份 2015 

关键词 副溶血弧菌  基于碱基序列的多位点序列分型  基于肽链的多位点序列分型  克隆复合体 

文摘内容 为了了解来自全球的副溶血弧菌环境菌株的群组结构和克隆复合体构成,利用PubMLST公共数据的数据,筛选其中具有完整序列分型(sequence type,ST)及肽序列型(peptide sequence type,pST)的来自全球的副溶血弧菌环境菌株数据,进行亚群分析和克隆复合体分析,并分别构建了基于ST型和pST型的最小生成树。结果表明,从数据库中共筛选到具有ST型及pST型的来自全球的副溶血弧菌环境菌株数据886条,共含有663个ST型,以ST3型为最多,但也仅含27条菌株信息。