基于RNA-seq技术对乌鳢和斑鳢肝脏的转录组分析

编号 zgly0001495205

文献类型 期刊论文

文献题名 基于RNA-seq技术对乌鳢和斑鳢肝脏的转录组分析

作者 刘凯  谢楠  冯晓宇  姚桂桂  潘彬斌 

作者单位 杭州市农业科学研究院 

母体文献 经济动物学报 

年卷期 2015年04期

年份 2015 

分类号 S917.4 

关键词 乌鳢  斑鳢  转录组  RNA测序  序列组装 

文摘内容 为满足标记辅助育种的要求,通过Illumina Solexa测序平台首次开展了乌鳢和斑鳢肝脏转录组测序。结果表明:乌鳢和斑鳢样本中分别得到85 802个和52 769个转录本,大小分别为113.75 Mb和44.29 Mb,组装后分别得到59 959个和44 337个Unigene,大小分别为45 Mb和27 Mb,序列平均长度为751.99 bp和608.88 bp。基因功能注释研究共获取了26 284个和24 812个特异蛋白,根据特异蛋白注释结果进行GO分析,分别有20 682和21 752条Unigene有GO注释;采用GO功能分类工具可将已注释转录物序列划分为分子功能、生物途径和细胞成分3类,为下一步开展生长等性状相关基因功能验证研究以及分子标记辅助育种等提供了丰富的序列资源。