毛白杨α-微管蛋白基因家族的克隆与序列分析

编号 zgly0000955719

文献类型 期刊论文

文献题名 毛白杨α-微管蛋白基因家族的克隆与序列分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 饶国栋  睢金凯  张建国 

作者单位 国家林业局林木培育重点实验室  中国林业科学研究院林业研究所  南京林业大学南方现代林业协同创新中心 

母体文献 林业科学研究 

年卷期 2015(1)

页码 44-49

年份 2015 

关键词 α-微管蛋白  生物信息学  系统进化  三维结构模拟 

文摘内容 采用本地化软件Blast P对杨树全基因组数据库和Gen Bank数据进行搜索,根据搜索结果对毛白杨TUA基因家族进行克隆,并利用软件Clustal W和MEGA对TUA基因进行了核酸和氨基酸序列的比对分析和系统进化分析;利用SWISS-MODEL服务器对TUA的蛋白质三维结构进行模拟。结果显示:毛白杨α-微管蛋白由8个成员构成,8个成员的氨基酸序列和其它植物α-微管蛋白序列的相似性在80%以上;TUA基因可分为2个家族,每个家族成员都有其独特的内含子外显子特征;TUA蛋白的三维结构表现出极高的相似性。毛白杨TUA基因在序列和结构上都十分保守;8个TUA基因起源于2个祖先TUA基因。