杜鹃花表达序列标签资源中的微卫星信息分析

编号 zgly0000829553

文献类型 期刊论文

文献题名 杜鹃花表达序列标签资源中的微卫星信息分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张传进 

作者单位 黄冈师范学院 

母体文献 湖北林业科技 

年卷期 2014(2)

页码 7-10

年份 2014 

分类号 Q786 S685.21 

关键词 杜鹃花  微卫星  表达序列标签  遗传多样性 

文摘内容 从NCBI数据库下载杜鹃花表达序列标签序列1323条, 去冗余后得到912条EST。采用Tandemrepeatfinder软件分析, 最终在61条EST序列中找到65个SSR位点, 出现频率为7.1272%。二碱基重复是杜鹃花EST内SSR的主要重复类型, 占66.1538%; 单碱基和三碱基重复次之, 分别占据15.3846%和9.2308%。四碱基、五碱基、六碱基类型的SSR相对比较少。多达90.7692%的SSR位点为完美型微卫星重复。这些富含SSR位点的EST序列将为开发微卫星特异性引物, 并用于杜鹃花群体生物多样性和遗传结构分析提供理论依据。