西施舌5个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析

编号 zgly0001375756

文献类型 期刊论文

文献题名 西施舌5个地理群体ITS1序列变异及系统发生分析

作者 孟学平  高如承  申欣  王帅  程汉良  董志国  阎斌伦 

作者单位 淮海工学院海洋学院江苏省海洋生物技术重点实验室  福建师范大学生命科学学院 

母体文献 生态学报 

年卷期 2010年20期

年份 2010 

分类号 Q953  S917.4 

关键词 西施舌  ITS1  序列分析 

文摘内容 利用核糖体rRNA基因第一内转录间隔区(ITS1)序列,对我国山东日照(RZ)、江苏连云港(LYG)和启东(QD)、福建长乐(CL)、广西北海(BH)沿海西施舌5个野生群体的遗传结构进行了分析。经PCR扩增、克隆、非克隆测序,获得长度为816—843bp的ITS1核苷酸序列,其平均G+C含量(60.8%)显著高于A+T含量。在西施舌5个群体93个个体118个序列中共检测到153个变异位点,多态位点比例为18.3%,其中,简约信息位点为63个,共有63种基因型。群体间遗传距离在0.74%—3.38%之间,群体内遗传距离为0.72%—1.06%之间。CL群体与其他4个群体间的遗传距离明显高(3.17%—3.38%)。AMOVA分析结果显示长乐群体有明显的遗传分化(FST=0.670—0.702,P(0.001)。以中国蛤蜊为外群构建的NJ树和ML树显示CL群体聚为一支,非长乐群体互相重叠聚为另一支,研究结果显示,长乐群体已经形成了具有明显遗传结构的地理种群。