基于ITS2和16S rRNA的西施舌群体遗传差异分析

编号 zgly0000821613

文献类型 期刊论文

文献题名 基于ITS2和16S rRNA的西施舌群体遗传差异分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 孟学平  申欣  赵娜娜  田美  曾云  陈建安  董志国  程汉良  阎斌伦 

作者单位 淮海工学院海洋学院 

母体文献 生态学报 

年卷期 2013(24)

页码 7882-7891

年份 2013 

分类号 Q987 

关键词 西施舌  群体  ITS1  16S  rRNA  遗传差异  二级结构 

文摘内容 目前, 我国西施舌群体分子遗传差异研究结果存在争议。分析我国南北沿海(9个群体)、与广西北海毗邻的越南(1个群体)西施舌核DNA的内转录间隔区2(ITS2)和线粒体DNA的16S rRNA基因(16S)片段核苷酸序列及其二级结构, 为解决争议问题提供分子生物学资料。扩增获得西施舌ITS2片段和16S序列, 其长度分别为389-402 bp和306 bp, 加之下载序列共147条; 序列分析显示, 74个ITS2序列共有17种基因型, 73个16S序列有15种单倍型, 其中, 长乐(CL)群体独享9种ITS2基因型和5种16S单倍型, 非长乐群体(nCL)多数为群体间交叉共享1种或几种基因(单倍)型; 基因(单倍)型核苷酸变异位点占5.7%(ITS2)和11.8%(16S); 基于ITS2和16S的CL群体和nCL群体间的遗传距离与群体内遗传距离之比分别为2.42和11.08, nCL群体间的平均遗传距离均为0.007; 二级结构显示CL群体ITS2的9种基因型和16S的5种单倍型均区别于nCL群体, nCL的ITS2和16S二级结构分别相似; ITS2和16S基因的系统发育分析显示, CL西施舌形成支持率很高(98, 96)的单系支, 而nCL群体则交叉聚为另一支(98, 96)。研究结果揭示, 福建西施舌是腔蛤蜊属(Coelomactra)的一个新种。