基于EST序列的杨树候选SNPs标记分析

编号 zgly0000637077

文献类型 期刊论文

文献题名 基于EST序列的杨树候选SNPs标记分析

学科分类 220.1070;森林植物学

作者 张新叶  宋丛文  杨彦伶  张亚东  黄敏仁 

作者单位 湖北省林业科学研究院  南京林业大学林木遗传和基因工程实验室 

母体文献 华中农业大学学报 

年卷期 2009(6)

页码 741-745

年份 2009 

分类号 S792.11 

关键词 单核苷酸多态性  表达序列标签  杨树 

文摘内容 利用生物信息学方法对来自2个不同cDNA文库的2万余条杨树EST序列进行了候选SNPs标记。研究结果表明，在获得的94个碱基替代型候选SNPs中，A／G替换类型最多，占32．98％，C／T替换型占13．83％，其它碱基置换型SNPs占53．20％。同时，对其中20个候选SNPs位点的重新测序结果表明，有13个（占65％）候选SNPs位点得到证实，其中，11个位点为碱基替代型SNPs，另外2个为杂合型位点。