杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析(英文)

编号 zgly0000716462

文献类型 期刊论文

文献题名 杨树抗黑斑病相关基因表达谱分析(英文)

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 张新叶  宋丛文  黄敏仁 

作者单位 湖北省林业科学研究院  南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室 

母体文献 林业科学 

年卷期 2011,47(1)

页码 85-94

年份 2011 

分类号 S763.15 

关键词 杨树  表达序列标签  抗病相关候选基因  表达谱 

文摘内容 利用黑斑病的高抗无性系美洲黑杨I-69及黑斑病的高感无性系欧美杨I-45为材料建立的2个cDNA文库,随机挑取cDNA克隆进行5’端EST序列测序,共获得有效序列20023条。序列经聚类分析和拼接后,共获得10816个Unigene,其中包括3734个Contig,7082个独立的Singleton。被注释的8853个具有同源性匹配序列基因中,按照GO的分子功能、生物过程和细胞组分3个不同分类角度进行分类。在具有功能注释的8853个Unigene中,选出330个与完成全基因组测序的毛果杨序列进行BLAST分析,结果发现有177个抗病相关候选基因出现在282个Unigene中,其中135个分布于杨树的18个不同连锁群上,其他42个基因位于还没定位的scaffolds上。所测定的这些EST序列为后期在基因组水平上研究杨树黑斑病的水平抗性遗传机制及进一步的相关基因发现奠定基础。