山杏CAT家族基因的生物信息学预测及表达分析

编号 zgly0001652545

文献类型 期刊论文

文献题名 山杏CAT家族基因的生物信息学预测及表达分析

作者 刘力力  林子欣  胡锦赫  安基永  王佳  林善枝 

作者单位 北京林业大学生物科学与技术学院 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年22期

年份 2018 

分类号 S662.2 

关键词 山杏果实  阳离子氨基酸转运体  家族基因  生物信息学分析  转录表达 

文摘内容 CAT (Cationic amino acid transporters)作为一类跨膜转运蛋白,广泛参与植物体内氨基酸的吸收与转运。为了深入研究CAT家族基因在蛋白质累积过程中的调控作用,本研究以山杏(Prunus sibirica L.)果实为试材,以前期所获得的不同发育期山杏果实转录组测序数据为依据,通过功能注释与分析获得了6个CAT家族成员基因,分别命名为PsCAT1、PsCAT2、PsCAT5、PsCAT7、PsCAT8和PsCAT9。生物信息学分析结果表明,山杏果实PsCAT家族基因均含有完整的开放阅读框,可编码以α-螺旋二级结构为主、不含信号肽的非分泌蛋白,且含有多个磷酸化位点;除Ps CAT2蛋白外,其余5个Ps CAT蛋白均为碱性蛋白,而除了Ps CAT5蛋白定位于线粒体外,其余均为内质网定位的强疏水性的跨膜转运蛋白。同时,采用qRT-PCR技术对PsCAT基因在不同发育山杏果实中的动态转录表达进行检测,结果发现,PsCAT2、PsCAT5和PsCAT7在30 DAF时表达量最高,而PsCAT1、PsCAT8和PsCAT9在60 DAF时表达量最高;另外,PsCAT2在不同发育山杏果实中的表达量均显著高于其它PsCAT基因,推测其可能在山杏果肉蛋白累积过程中起主导作用。研究结果可为后续研究山杏果肉蛋白的累积规律及调控机理提供科研依据,具有重要的学术价值。