紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析

编号 zgly0001390822

文献类型 期刊论文

文献题名 紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析

作者 张文娟  李聪  王涌鑫  苗丽宏 

作者单位 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2010年02期

年份 2010 

分类号 S541.9  Q943.2 

关键词 紫花苜蓿  几丁质酶  ClassⅢ基因  生物信息学 

文摘内容 本文根据截叶苜蓿(Medicago truc atula)几丁质酶ClassⅢ基因(GenBank:AY294484.1)的全长序列设计引物,通过RT-PCR的方法得到紫花苜蓿(Medicago sative)几丁质酶ClassⅢ的核酸序列,命名为MsChiⅢ,在NCBI中的登录号为FJ872918。利用生物信息学软件分析MsChiⅢ,预测氨基酸序列的等电点、二级结构和三级结构,并构建系统发育树。结果显示该核酸序列全长为953bp,包括完整的开放阅读框,编码301个氨基酸,等电点为8.212。该序列所编码的蛋白属于几丁质酶18家族的内切酶,分布于细胞间隙,并含有几丁质酶18家族的特征序列——LGDVDFDIE,并预测MschiⅢ可能是一种具有几丁质酶和溶菌酶的双功能酶。