β-内酰胺类抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响

编号 zgly0001660253

文献类型 期刊论文

文献题名 β-内酰胺类抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响

作者 张帅  曲永利  李伟  辛小月  王璐  殷术鑫 

作者单位 黑龙江八一农垦大学动物科技学院 

母体文献 中国草食动物科学 

年卷期 2019年01期

年份 2019 

分类号 S823 

关键词 犊牛  抗奶  瘤胃菌群  差异表达基因  抗性基因 

文摘内容 为探究抗奶对犊牛瘤胃菌群差异基因表达及代谢的影响,选取45头3日龄左右、体重40 kg±5 kg的健康荷斯坦犊牛,随机分为3组,分别饲喂巴氏消毒抗奶(B1)、抗奶(B2)和无抗鲜奶(B3),于60(T1)、90(T2)和180(T3)日龄,每组选取6头采集瘤胃液,构建犊牛瘤胃细菌宏基因组文库,并使用illumina MiSeq测序后通过NOG、KEGG和CAZy数据库进行生物信息学分析和功能注释。结果显示:(1)9个样品在eggNOG数据库中比对共有86 145条基因得到了相应的功能注释;CAZy数据库在9个功能类共获得33 980条注释;在KEGG通路注释得到1 905条。(2)T1-T2、T1-T3、B1-B2和B1-B3四组分别含有318、1 398、30和24个差异表达基因(DEGs)。T1-T2组和T1-T3组DEGs在细胞周期及氨基酸生物合成代谢途径中明显富集,其中细胞周期代谢主要的DEGs为糖原合酶激酶-3β基因(Glycogen synthase kinase-3β,GSK-3β);周期蛋白依赖性激酶2基因(Cyclindependent kinase 2,CDK2)和周期蛋白依赖性激酶7基因(Cyclin-dependent kinase 7,CDK7)。(3)试验共检测到6类抗生素抗性基因,共19种基因型。进一步分析抗生素耐药性产生机制,其中由外排泵(Efflux pump)引起的所占比例最大。说明牦牛随日龄的增加瘤胃菌群丰度提高,瘤胃菌群中的差异表达基因GSK-3β、CDK2和CDK7可能影响犊牛早期生长的乳脂代谢。