以早期寒武纪辐射为例研究在松弛的分子钟模型下进化速度估计的精确性

编号 zgly0001298909

文献类型 期刊论文

文献题名 以早期寒武纪辐射为例研究在松弛的分子钟模型下进化速度估计的精确性

作者 黄祖石 

母体文献 昆虫知识 

年卷期 2005年04期

年份 2005 

分类号 Q11 

关键词 分子钟  寒武纪  进化速度  似然法  速度估计  进化树  精确性  分子进化  变化模型  松弛 

文摘内容 选择理由:进化速度的估计对于系统发生,分子进化的研究非常重要,但准确地估计物种的进化速度又是非常困难的。关注这方面的研究对于从事相关领域的研究者就很重要了。近年来,发展了许多系统发生方法用以估计分子速度和分化时间,这些方法都是基于这样的模型,即认为速度改变遍及整个进化树来放宽分子钟的限制。这些方法正在被广泛使用,但很少有研究涉及它的精确性。作者用基于9个分类单元构建的进化树的模拟序列数据检测几个松弛分子钟方法(罚分似然法(penalizedlikelihood)和用各种速度变化模型的贝叶斯法)的精确性。当这些序列以不变的速度进化时,这些方法能正确地推测进化速度,在假设分子钟存在的情况下,速度估