家蚕地方品种线粒体基因组A+T丰富区的序列及分子进化分析

编号 zgly0001329202

文献类型 期刊论文

文献题名 家蚕地方品种线粒体基因组A+T丰富区的序列及分子进化分析

作者 陈丽媛  赵巧玲  沈兴家  张志芳  唐顺明  徐安英  张国政  郭锡杰 

作者单位 江苏科技大学  中国农业科学院蚕业研究所农业部家蚕生物技术重点开放实验室  江苏科技大学 镇江212003中国农业科学院蚕业研究所农业部家蚕生物技术重点开放实验室镇江212018  镇江212018  镇江212003  中国农业科学院蚕业研究所  农业部家蚕生物技术重点开放实验室 

母体文献 蚕业科学 

年卷期 2007年01期

年份 2007 

分类号 S881.26 

关键词 家蚕  线粒体DNA  A+T丰富区  分子进化  起源 

文摘内容 为了研究家蚕线粒体基因组A+T丰富区的结构和家蚕品种的进化,用PCR方法扩增了12个家蚕(Bombyxmori)地方品种线粒体基因组A+T丰富区及其侧翼序列,分离纯化后克隆到pMD18-T载体进行测序。序列分析表明,克隆片段长度约1.1 kb,基因排列顺序与C108线粒体相同,依次为12S rRNA基因3′端、A+T丰富区、tRNAMet、tRNAIle、tRNAGln和ND2基因5′端,在tRNAGln和ND2基因之间有47 bp的非编码区。以日本野桑蚕(Bombyxmandarina)为外群,用Phylip软件包构建了基于12个家蚕品种线粒体基因组A+T丰富区序列的NJ进化树。结果显示,甘肃种单独聚为一群,其进化早于其它11个品种聚成的类群,说明甘肃种是供试家蚕品种中进化最早的品种。这一结果在分子水平上为黄河流域是家蚕品种的发祥地之一提供了证据,也进一步支持了家蚕品种的中国起源说。对A+T丰富区及其侧翼基因的结构分析表明,家蚕线粒体12S rRNA和ND2基因都十分保守,14个品种统计只分别发生1个和2个碱基转换;A+T丰富区中(A+T)比例高达94.9%以上,第27 nt开始有1个T-串结构,长度为16~19 bp不等;同时还根据3个tRNA基因的核苷酸序列推定了其二级结构。