两种短命植物HRD转录因子基因的克隆及序列分析

编号 zgly0001497027

文献类型 期刊论文

文献题名 两种短命植物HRD转录因子基因的克隆及序列分析

作者 陈琴  曲延英  刘静静  朱燕飞  姚正培  陈全家 

作者单位 新疆农业大学农学院  新疆农业大学农业技术重点实验室 

母体文献 植物研究 

年卷期 2015年02期

年份 2015 

分类号 Q943.2 

关键词 短命植物  HRD基因  转录因子  基因克隆  生物信息学分析 

文摘内容 以新疆短命植物线果芥(Conringia planisiliqua L.)和大蒜芥(Sisybrium altissimum L.)为试验材料,采用同源序列克隆的方法,分别从线果芥和大蒜芥c DNA中克隆得到了一条HRD转录因子基因,命名为Cp HRD和Sa HRD。通过生物信息学分析,Cp HRD和Sa HRD转录因子基因开放阅读框长564 bp,与山嵛菜(Eutrema salsugineum)、琴叶拟南芥(Arabidopsis lyrata)、荠菜(Capsella rubella)及拟南芥(Arabidopsis thaliana)核苷酸序列的同源性分别为88%、87%、87%和86%,编码187个氨基酸,基因编码蛋白分子量约为20 k D,二级结构包括2个β-折叠、5个a-螺旋和无规则卷曲,属含有信号肽的亲水性非跨膜稳定蛋白。亚细胞定位主要在细胞核中,系统进化树分析表明线果芥、大蒜芥和拟南芥属于同一种属,拥有1个典型的AP2/EREBP功能结构域,推测Cp HRD和Sa HRD基因属于AP2/EREBP转录因子家族EREBP亚组,可能参与植物ABA、干旱和低温等环境胁迫的应答过程,与植物的抗逆性有关。本研究为进一步深入探索HRD基因功能及其抗旱机制奠定了基础。研究同时也为短命植物种质资源的开发和利用发掘了新基因。