紫竹PPO基因的生物信息学及表达分析

编号 zgly0000825778

文献类型 期刊论文

文献题名 紫竹PPO基因的生物信息学及表达分析

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 关鹰  王弋  郭小勤  林新春  方伟 

作者单位 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室 

母体文献 浙江林业科技 

年卷期 2013(2)

页码 10-14

年份 2013 

分类号 S718.46 

关键词 紫竹  PPO基因  多酚氧化酶  单核苷酸多态性 

文摘内容 以紫竹(Phyllostachys nigra)一年紫嫩叶的eDNA为材料获得—个多酚氧化酶基因(命名为PnPPO1)片段, 测序显示, 该序列长438bp, 该片段编码有146个氨基酸残基组成的多酚氧化酶保守区, 该区域包含CuB结合区, 其编码的蛋白属于酪氨酸酶(tyrosinase)。Blastp分析显示, 该氨基酸序列与小麦(Triticum aestiv)、水稻(Oryza sativa)中的多酚氧化酶有很高的同源性。该蛋白片段分子量约为36.2kD, pI为5.03。比对一年紫和台湾紫中该基因的序列发现, 两者同源性为84.45%, 两者间还存在明显的SNP位点会导致酶切点位发生变化和新酶切位点的产生。RT-PCR分析结果表明, PnPPO1基因在叶芽中表达最高, 鞭根中微量表达, 其余供试组织中未检测到其表达。