‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析

编号 zgly0001359180

文献类型 期刊论文

文献题名 ‘岩溪晚芦’椪柑果皮与果肉差减cDNA文库的构建及初步分析

作者 叶庆亮  江东  彭爱红 

作者单位 中国农业科学院柑橘研究所 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2009年07期

年份 2009 

分类号 S666 

关键词 柑橘  抑制性差减杂交(SSH)  cDNA文库  表达序列标签  克隆  差异表达基因 

文摘内容 以‘岩溪晚芦’椪柑(Citrus reticulata Blanco)成熟果实果皮和果肉为材料,采用抑制性差减杂交技术成功构建了果皮(tester)与果肉(driver)的差减cDNA文库。结果显示:cDNA克隆外源插入片段大小介于100～500bp之间。成功对411个克隆进行了测序,测序结果经与NCBI基因库中序列进行比较,377个EST找到了同源序列,它们分属于126个基因,涉及到色素合成、能量代谢、初级代谢、次生代谢、抗逆防御、蛋白代谢、信号转导、香味形成、果皮软化(衰老)、精油合成、抗氧化等代谢途径和生理生化过程。还有一些基因涉及到三价铁螯合物、反转录转座子gag蛋白、查尔酮合成、硼离子转运、儿茶酚氧位甲基转移酶等功能。功能已知且没有重复的EST共有63个,占总数的49.2%。有5个基因共62个克隆虽在Blast搜索时找到了较高的同源性序列,但功能目前尚未明确。另有34个基因未搜索到同源序列,可能为新发现的基因。