葡萄实时定量PCR中稳定内参基因的筛选

编号 zgly0001523582

文献类型 期刊论文

文献题名 葡萄实时定量PCR中稳定内参基因的筛选

作者 查倩  奚晓军  蒋爱丽  田益华  王世平 

作者单位 上海农业科学院林木果树研究所  上海交通大学农学与生物技术学院 

母体文献 果树学报 

年卷期 2016年03期

年份 2016 

分类号 S663.1 

关键词 葡萄  ge Norm  内参基因  标准化因子  实时荧光定量PCR 

文摘内容 【目的】通过ge Norm软件筛选实时荧光定量PCR稳定内参基因,基于多内参基因评价体系进行目的基因相对表达量的计算。【方法】获得不同葡萄品种叶片和果皮中6个候选内参基因的循环阈值(Ct),利用ge Norm软件计算内参基因平均表达稳定性数值M和基因配对差异值V,从而判断内参基因最适组合。【结果】发现候选内参基因表达稳定性由高到低的排列顺序为Vv EF1r=Vv EF1-α>Vv GAPDH>Vv ACTIN>Vv ACT1>Vv UBQ,不同组织分别分析均发现Vv EF1-α和Vv EF1r的稳定性最高,且基因配对差异值V2/3为0.104,所以内参基因的最适组合为Vv EF1-α和Vv EF1r。利用ge Norm软件计算得到的多内参基因评价体系的标准化因子可应用于目的基因的相对表达量分析。【结论】ge Norm软件筛选实时荧光定量PCR稳定内参基因的方法可以应用到多条件和多组织的不同植物样本中,并用于目的基因表达谱的研究,具有重要的广泛应用价值。