菊芋实时定量PCR分析中内参基因的选择

编号 zgly0001577191

文献类型 期刊论文

文献题名 菊芋实时定量PCR分析中内参基因的选择

作者 宋向阳  杨世鹏  钟启文  王丽慧  赵孟良  李莉  孙雪梅 

作者单位 青海大学农林科学院青海省蔬菜遗传与生理重点实验室  青海大学三江源生态和高原农牧业国家重点实验室 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2018年04期

年份 2018 

分类号 S632.9 

关键词 菊芋  实时荧光定量PCR  内参基因 

文摘内容 实时荧光定量PCR具有灵敏度、特异性和重复性好等优点,是植物中常用于基因表达和转录分析的重要手段。在分子生物学的研究中,选择表达相对稳定的内参基因是分析实时荧光定量实验数据的前提。本研究以菊芋(Helianthus tuberosus)开花时期的幼根、嫩茎、叶片、块茎和花瓣为材料,运用荧光定量PCR方法分析了18S rRNA、EF1α、Actin、β-actin、GAPDH、25S rRNA和UBQ5 7个内参基因的表达量,通过Ge Norm、Norm Finder和Best Kkeeper软件的综合分析,发现25S r RNA的稳定性最好,可用于菊芋基因表达的内参基因。而GAPDH在不同样品中稳定性最差,不适合作为内参基因。本研究为菊芋实时荧光定量PCR中内参基因的选择提供了参考。